微阵列芯片的分类

微阵列芯片的分类

按照芯片上的探针对微阵列芯片进行分类，有核酸芯片、蛋白质芯片和组织芯片等，目前应用最广泛的是核酸芯片，核酸芯片又有两种类型，分别是cDNA微阵列和寡核苷酸微阵列。 cDNA基因文库由PCR产物组成，为双链结构，长度一般在数百至数千碱基对，因而芯片的杂交条件对每个基因不能保证是最佳的，假阳性率较高，因此，判定cDNA微阵列 的最终结果时，有必要对筛选出的基因进行测序。在应用cDNA微阵列进行研究时，一般需要提供一个对照样本，将其与需要研究的标本给予不同的标记，将二者灯亮混合后共同注入芯片进行孵育。扫描后得到的原始数据是各个单元格中信号强度的比率。

同时cDNA芯片的靶点是把从实验样本和对照标本中提取出来的RNA总体或其中的mRNA作为模板，通过反转录合成cDNA，分别标记后称为靶点。 寡核苷酸基因文库为人工特异性合成，长度一般在100mer以下，不存在序列错误问题，假阳性率低，芯片的结果可以直接使用。

寡核苷酸微阵列 使用的研究样本和对照标本需各用一个寡核苷酸芯片，原始数据是每一个单元格中信号强度的绝对值。

寡核苷酸芯片的靶点制备多了一个从单链cDNA合成双链cDNA，再由此转录为cRNA的过程，这一增加的转录过程使直接从样本中提取的RNA扩增了大约50倍，从而有效地提高了对于微小计量标本的研究效率，扩展了寡核苷酸芯片的应用范围。